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pcr實驗室應用于臨床、診斷、教學、或者生產設施，在該級別中開展有關內源性和外源性病源的工作，若暴露而吸入該病源會引發嚴重的可能致死的疾病。實驗室設雙重門或氣閘室和外部隔離的實驗區域，非本處工作人員禁止入內，實驗室內全負壓，使用Ⅱ級生物安全柜進行實驗，以高效過濾器把室內空氣過濾后排到室外；
有些危險的外源性病源，具備因氣溶膠傳播而致實驗室感染和導致生命危險疾病的高度個體風險，有關工作應在pcr實驗室中進行。采用獨立的建筑物內隔離區和外部隔斷的構造，室內保持負壓，使用Ⅲ級生物安全柜進行實驗，設置空氣隔斷裝置，淋浴室，操作工作人員應穿防護服，非本處工作人員禁止入內。生物安全實驗室設計上的核心是動態隔離，排風措施是重點，強調就地消毒，重視潔污分流，防止意外擴散，需要適度潔凈。
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